Kahjulikkus ja riskid, nagu valu, verejooks ja infektsioon, võivad tekkida normist kõrvalekalduvate sõeluuringu tulemuste selgitamiseks vajalike lisauuringute ning sõeluuringuga kindlaks tehtud kahjustuste ravi tõttu. Ligikaudu 1 naist 5st või 6st, kellele tehti lisauuringuid ilma kaasuva ravita, teatasid valust, verejooksust või voolusest, mis tekkis kuue nädala jooksul uuringutest. Ravi võib põhjustada ärevust ja harvadel tingimustel ka enneaegset sünnitust ja lapse väikest sünnikaalu. Kõigist sõeluuringuga tuvastatud vähieelsetest kahjustustest ei teki ravimata jätmisel vähki, kuid ei ole võimalik prognoosida, millised kahjustustest paranevad iseeneslikult ja millistest tekib vähk, seepärast on eelistatav ravida kõiki selliseid kahjustusi.

Vähieelsete kahjustuste ülediagnoosimise ja asjatu ravi riski saab vähendada, kui osaleda vaid ametlikes sõeluuringu programmides, st sellise programmi kaudu kutse saamisel. Soovitatav on enne 25. eluaastat sõeluuringus mitte osaleda, kuid kui avaldub murettekitavaid sümptomeid, nagu ebaharilik tupeverejooks mis tahes vanuses, tuleb konsulteerida arstiga.

Inimese papilloomiviiruse (HPV) uuringut ei soovitata emakaelavähi sõeluuringuks, sest infektsioon paraneb sageli ravita, eriti alla 30.–35. aasta vanustel naistel. Seepärast ei soovitata noorte naiste puhul selle uuringu kasutamist.