Škodljive posledice ali tveganja, kot so bolečina, krvavitev in okužba, so lahko posledica dodatnih preiskav, ki so potrebne za razjasnitev nenormalnih izidov presejalnega testa, ter zdravljenja lezij, odkritih pri presejanju. Približno 1 od 5 ali 6 žensk, pri katerih so bile opravljene dodatne preiskave brez zdravljenja, je v šestih tednih poročala o bolečinah ali krvavitvah ali močnem izcedku. Zdravljenje lahko povzroči zaskrbljenost in v redkih primerih tudi prezgodnje rojstvo z nizko porodno težo. Vse predrakave lezije, odkrite med presejanjem, se ne bi razvile v raka, če se ne bi zdravile, ker pa ni mogoče napovedati, katere bi se pozdravile spontano in katere bi se razvile v raka, je bolje zdraviti vse.

Tveganje prediagnosticiranja ali čezmernega zdravljenja predrakavih lezij lahko zmanjšate le z udeležbo na testiranju v okviru organiziranega presejalnega programa, tj. ko dobite vabilo programa. Svetujemo vam, da presejalnega pregleda za odkrivanje raka materničnega vratu ne opravite pred 25. letom, če pa opazite kakršne koli zaskrbljujoče simptome, kot je neobičajna krvavitev iz vagine pri kateri koli starosti, se posvetujte z zdravnikom.

Ni priporočljivo, da bi se test na HPV uporabljal zunaj organiziranega programa, saj se okužba pogosto pozdravi brez zdravljenja, zlasti pri ženskah, mlajših od 30–35 let. Zato uporaba tega testa pri mlajših ženskah ni priporočljiva.