Zgodnie z zaleceniami Światowej Organizacji Zdrowia (WHO) noworodki powinny otrzymać pierwszą dawkę szczepionki w ciągu 24 godzin od urodzenia, jeżeli jest to możliwe. W większości państw Unii Europejskiej (UE) istnieje program szczepień wszystkich noworodków przeciw wirusowemu zapaleniu wątroby typu B.

W kilku państwach UE (w Wielkiej Brytanii i w niektórych państwach nordyckich) szczepienia przeciw wirusowemu zapaleniu wątroby typu B stosuje się tylko u noworodków, u których występuje wysokie ryzyko (tj. noworodków matek, które chorują na wirusowe zapalenie wątroby typu B). Każdy, kto mieszka w którymś z tych krajów, może rozważyć zaszczepienie dziecka na własny koszt po konsultacji z lekarzem lub innym świadczeniodawcą.