Probirna pretraga ili naknadne pretrage potrebne radi provjere abnormalnih nalaza probirnih pretraga i liječenje lezija otkrivenih tijekom probira mogu biti opasne i rizične.

Probiri pretragom na okultnu krv u stolici (FOBT) i fekalnim imunokemijskim testom (FIT) bezbolni su i sigurni. Međutim, FOBT‑om i FIT‑om može se otkriti krv u stolici koja nije povezana s rakom crijeva ni s polipom. Ako se u stolici pronađe krv, ponudit će vam se naknadne pretrage kolonoskopijom (vidi Naknadna kolonoskopija u nastavku). Osobe upućene na naknadne pretrage zbog abnormalnih nalaza probirne pretrage katkad dožive tjeskobu, ali to obično ne traje dugo.

Mnogi pacijenti pri fleksibilnoj sigmoidoskopiji dožive barem neki stupanj neugode ili bolova, ali manje nego kod kolonoskopije. Manje komplikacije (mučnina, nesvjestica, vrtoglavica ili bolovi u trbuhu) pojavljuju se u manje od jedne na 150 fleksibilnih sigmoidoskopija. Veće komplikacije, uključujući teško krvarenje ili razdor stijenke crijeva, događaju se približno kod jedne od 3 000 fleksibilnih sigmoidoskopija. Teški bolovi odmah nakon te pretrage događaju se kod jednog među 50 pacijenata.

Kao i kod probira FOBT‑om na bazi gvajaka ili FIT‑om, abnormalni nalaz probira zahtijeva naknadnu pretragu kolonoskopijom (vidi Naknadna kolonoskopija u nastavku).

Mnogi pacijenti pri kolonoskopiji dožive barem neki stupanj neugode ili bolova. Priprema crijeva laksativima (tj. priprema sredstvima za čišćenje crijeva koja je potrebna prije kolonoskopije) u pravilu se doživljava kao najgori dio toga postupka. U većini slučajeva u kojima se probirom kolonoskopijom otkriju polipi ili mali tumori raka izbjegava se druga pretraga zato što je već prvom obuhvaćena i gornja polovina crijeva. U Europskoj uniji ozbiljne komplikacije prijavljene su kod približno jedne do pet od tisuću pretraga. Komplikacije su izglednije kod kolonoskopije pri kojoj se polipi otkriju i uklanjaju. U iznimno rijetkim slučajevima kolonoskopija može dovesti do smrti.  

Naknadna kolonoskopija jest kolonoskopija koja se provodi radi naknadne provjere abnormalnog nalaza FOBT‑a na bazi gvajaka ili FIT‑a ili kako bi se provjerila gornja polovina crijeva kod osoba s abnormalnim nalazima probira sigmoidoskopijom. Nosi nešto viši rizik od komplikacija nego probirna kolonoskopija zbog toga što su veći izgledi da će se polipi ili tumori raka pronaći i uklanjati. Mnogi od tih polipa koji se uklanjaju pri probiru ne bi se za života pacijenta razvili u rak, ali nije moguće predvidjeti koji će se polip razviti u rak. Ozbiljne komplikacije u Europi prijavljene su kod približno jedne od 200 naknadnih kolonoskopija. Veći je rizik od komplikacija pri operaciji ako se polip ili rak ne može ukloniti kolonoskopijom. U iznimno rijetkim slučajevima (jedna na 10 000 pretraga) kolonoskopija može dovesti do smrti, no broj probirom spriječenih smrti od raka crijeva mnogo je veći.