Jos FOB-testin tai FIT-testin tulos on poikkeava, potilaalle tarjotaan mahdollisuus päästä kolonoskopiaan. Yhdellä tai kahdella 20:stä FOB- tai FIT-testissä poikkeavan tuloksen saaneesta löydetään syöpä jatkotutkimuksena tehdyssä kolonoskopiassa. Noin neljällä kymmenestä FOB- tai FIT-testissä poikkeavan tuloksen saaneesta löydetään polyyppeja, jotka poistetaan syövän ehkäisemiseksi. Noin puolet jatkotutkimuksena tehtyyn kolonoskopiaan osallistuneista saa normaalin tuloksen (ei syöpä- tai polyyppilöydöksiä).
Pienet sigmoidoskopian yhteydessä havaitut polyypit voidaan poistaa saman tien. Jos polyyppeja on paljon tai ne ovat suuria, henkilölle tarjotaan mahdollisuutta päästä kolonoskopiaan, jossa voidaan poistaa jo löydetyt polyypit sekä etsiä muita polyyppeja sigmoidoskopiassa tutkittua aluetta laajemmalta alueelta. Kun runsaslukuiset tai suuret polyypit on löydetty ja poistettu, henkilölle suositellaan käymistä säännöllisesti kolonoskopiassa.