Οι σύγχρονες θεραπείες για την ηπατίτιδα C διαρκούν αρκετούς μήνες και ενδεχομένως να έχουν δυσάρεστες παρενέργειες, όπως κόπωση, πονοκέφαλο, ναυτία, εξανθήματα και αναιμία. Επί του παρόντος αναπτύσσονται νέες θεραπείες, οι οποίες αναμένεται να είναι διαθέσιμες στο μέλλον.