Πολλά άτομα που έχουν μολυνθεί από τον ιό της ηπατίτιδας C (περίπου τα 75 από τα 100 μολυσμένα άτομα) εκδηλώνουν χρόνια φλεγμονή του ήπατος. Στο 1/5 των περιπτώσεων, η συγκεκριμένη πάθηση οδηγεί σε καρκίνο του ήπατος (περίπου 15 στα 100 μολυσμένα άτομα). Αντίθετα με ό,τι συμβαίνει στην ηπατίτιδα Β, ο κίνδυνος χρόνιας λοίμωξης από τον ιό της ηπατίτιδας C δεν μειώνεται όταν η λοίμωξη προσβάλλει ενηλίκους. Όταν πάσχετε από χρόνια ηπατίτιδα C, η κατανάλωση αλκοόλ, το κάπνισμα ή η ταυτόχρονη προσβολή από τον ιό της ηπατίτιδας Β αυξάνουν τις πιθανότητες εμφάνισης καρκίνου του ήπατος.