Caso o resultado da sua PSOF ou do seu TIF seja anormal, ser-lhe-á sugerida a realização de uma colonoscopia como exame complementar. Uma colonoscopia complementar detetará cancro em 1 a 2 pessoas em cada 20 com resultados de PSOF ou TIF anormais. Serão ainda encontrados pólipos, removidos para prevenir o desenvolvimento do cancro, em 4 em cada 10 pessoas com resultados de PSOF ou TIF anormais. Cerca de metade das colonoscopias complementares apresentarão resultados normais (sem deteção de cancro ou pólipos).
Pequenos pólipos detetados durante o rastreio por sigmoidoscopia flexível podem ser imediatamente removidos. As pessoas com vários pólipos ou pólipos de grandes dimensões serão convidadas a realizar uma colonoscopia, a fim de os remover e procurar outros pólipos para lá do alcance do sigmoidoscópio. Após a deteção e remoção de vários pólipos ou de pólipos de grande dimensão, recomenda-se a realização de colonoscopias de rotina.