Ο εμβολιασμός είναι πολύ ασφαλής. Έχουν υποβληθεί ήδη σε εμβολιασμό περισσότερες από 170 εκατομμύρια γυναίκες και κορίτσια, και τα κυριότερα προβλήματα που έχουν αναφερθεί είναι πόνος στο σημείο της ένεσης, πυρετός, ζαλάδα και ναυτία. Πρόκειται για παρενέργειες μικρής διάρκειας, ενώ το εμβόλιο δεν έχει συνδεθεί με σοβαρά προβλήματα. Τα υπουργεία Υγείας, οι υγειονομικές αρχές της Ευρωπαϊκής Ένωσης και η Παγκόσμια Οργάνωση Υγείας (ΠΟΥ) διενεργούν ελέγχους ασφαλείας, και όποιο ουσιαστικό ζήτημα προκύψει υπόκειται σε προσεκτική ανάλυση.